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灵芝科真菌的生态分布主要在亚洲、美洲、大洋洲和非洲大陆热带和亚热带地域，少数分布在温带。地处北半球温带的欧洲仅有灵芝属的4种，而北美洲大约5种。我国地跨热带至寒温带，灵芝科种类多而分布广。中国的东南（包括台湾）、西南的生态条件皆属热带和亚热带气候，很适宜灵芝菌的繁殖生长，灵芝品种几乎遍及这一区域。青海、新疆、宁夏、甘肃北部、西藏大部分地区，由于干旱、高寒，森林树种和环境不适宜灵芝的生长，故少有发现。在中国北纬25·以南的热带区域，灵芝的种类非常丰富，共计有60余种，占中国灵芝科总数的70%。

灵芝一般生长在山区林地里面，一般每年6-8月份最多，环境潮湿，温度25℃-30℃左右，通风，有适量的光照。国内福建，河南，大西北等很多地方都有。

灵芝产地很多，最优秀的灵芝主产地是吉林长白山
人工种植的灵芝全国分四大区域，品质好，主要出口的是东北吉林长白山区域，环境无污染    灵芝功效成分高，其次是浙江、福建的武夷山区域，安徽一带大别山区域和山东鲁西区域。后二区域出口的不多，品质略差些。